Les joueurs jouant "EteRNA" viennent de battre la science professionnelle à cette découverte cruciale

La science citoyenne vient de passer au niveau suivant: les joueurs vidéo ont fait une découverte biologique, et celle-ci est maintenant publiée par une revue scientifique à comité de lecture.

Publié cette semaine dans le Journal de biologie moléculaire, une série de règles intuitivement élaborées sur la difficulté d’une forme particulière à obtenir grâce à la conception d’ARN. Ils ont constaté, par exemple, que plus une forme est symétrique, plus il sera difficile de concevoir un brin d'ARN correspondant.

Le collectif de joueurs vidéo a fait cette découverte en jouant, EteRNA, un jeu qui met au défi les joueurs de prendre des brins d’ARN et de les plier selon la forme désirée en modifiant leur composition chimique. Le problème scientifique du pliage de l'ARN en une forme particulière est complexe, mais le jeu n'en est pas une - aucune compréhension de la biochimie n'est nécessaire pour commencer à jouer.

Les joueurs ont abordé la question de la recherche de leur propre initiative, dans le but de donner aux nouveaux joueurs des outils leur permettant de juger de la difficulté relative de différents puzzles. Les résultats aideront à orienter les futures recherches biomédicales, car le nouvel ensemble de règles donne aux scientifiques une idée plus précise de la question de savoir si l’essai de plier l’ARN en une forme donnée est un exercice futile.

«Cette recherche suggère que le paradigme standard du crowdsourcing scientifique peut être renversé», déclare Rhiju Das, professeur de biochimie à Stanford. Inverse dans un email. EteRNA a été lancé en 2011 par Das et Adrien Treuille, professeur assistant en informatique à l'Université Carnegie Mellon. “ EteRNA les joueurs peuvent concevoir leurs propres questions de recherche et rédiger leurs propres documents. Dans cette recherche, il y avait un peu de conseils et de tests indépendants réalisés par des experts de mon laboratoire."

L'ARN synthétisé recèle un potentiel incroyable pour une nouvelle génération de médicaments et de traitements médicaux. S'il peut être replié dans la forme voulue, l'ARN peut être construit pour cibler des virus, des cancers et même des troubles génétiques spécifiques. CRISPR, un processus d'édition de gènes susceptible de modifier radicalement l'avenir de l'existence humaine, utilise l'ARN pour guider l'enzyme coupant l'ADN, Cas9, vers la section indésirable de l'ADN.

EteRNA a débuté en tant que forum permettant aux scientifiques experts de présenter des énigmes aux joueurs, mais il a depuis grandi au-delà. Le jeu et ses 100 000 joueurs inscrits entretiennent désormais une relation symbiotique et évolutive avec des scientifiques professionnels et des modèles informatiques conçus pour concevoir et tester la structure des ARN.

«Modélisation informatique et EteRNA ne sont pas exclusifs », déclare Das. “ EteRNA rassemble beaucoup de personnes, dont certaines écrivent leurs propres modèles informatiques."

Dans le présent article, les joueurs ont collaboré pour écrire des scripts afin de tester leurs idées sur ce qui rend les structures d'ARN difficiles à concevoir. Das a déclaré que certains joueurs lui avaient dit qu'ils étaient particulièrement enthousiastes à l'idée d'intégrer leurs idées dans des modèles informatiques, car ils souhaitaient résoudre des problèmes plus difficiles.

Problèmes construits par EteRNA Les joueurs continuent en fait à être synthétisés dans le laboratoire de Das - à ce jour, 86 459 séquences générées par les joueurs ont été construites sur IRL.

Les auteurs principaux du document ont été EteRNA les joueurs Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju et Michelle Wu. Wu est aussi un doctorat étudiant en informatique biomédicale à Stanford.

À l’avenir, il se peut que des experts citoyens commencent à publier des découvertes scientifiques en toute indépendance.

«Ce modèle de« crowdsourcing inversé »pour la science citoyenne pourrait être utile pour d’autres projets et domaines scientifiques, tels que l’astronomie (Galaxy Zoo) ou l'identification des espèces en provenance de la foule (Code à barres de la vie), Dit Das. «Surtout si, comme EteRNA, voient des goulots d'étranglement au stade de l'écriture de papier."