Rich Mahoney, Seismic - Stanford Medicine Big Data | Precision Health 2018
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À chaque instant, des milliards de microorganismes, produits chimiques et champignons des quatre coins du monde envahissent votre espace personnel, créant ainsi un nuage qui vous est propre. Pendant des années, ce nuage de microbiome, ou «exposome», est une boîte noire. Nous savons qu’il est là, mais nous n’avons pas encore les outils pour regarder à l’intérieur. À présent, une équipe de chercheurs de Stanford a mis au point un appareil portable capable de sonder ses profondeurs obscures. Un jour, ils espèrent pouvoir mettre leur technologie sur votre smartwatch.
Dans un article publié dans Cellule, les chercheurs ont compilé des données sur notre exposome basées sur 70 milliards de lectures de leur appareil. Ils ont identifié plus de 40 000 types différents de bactéries, virus et champignons qui persistent dans notre espace aérien, dont certains sont plus conviviaux que d'autres.
«Nous n’avons aucune idée de notre exposition environnementale», explique Michael Snyder, Ph.D., auteur principal d’études et directeur du Centre de génomique et de médecine personnalisée de Stanford. Inverse. «On ne sait pas vraiment quelle est la ventilation actuelle, en particulier avec les produits chimiques. Personne n’a vraiment étudié cela auparavant.
Certaines des choses invisibles auxquelles nous sommes exposés sont plutôt inoffensives et fluctuent d’une saison à l’autre. Par exemple, l'automne a tendance à amener certains types de moisissures et de levures dans notre orbite, tandis que certaines spores de champignons poussent au maximum en hiver, dit Snyder. Pendant les périodes de pluie, son appareil a également détecté des produits chimiques tels que la géosmine, le composé qui dégage une odeur «terreuse» après une tempête de pluie.
Mais certains nuages avaient une personnalité plus sinistre. L’exposome d’un participant à l’étude de San Francisco avait une grande quantité de Alkanindiges, bactérie généralement présente dans les boues d’épuration. D'autres ont montré des quantités de Aspergillus, un champignon qui peut parfois provoquer une moisissure dans les poumons humains. Et tous les 15 participants à l'étude présentaient des traces de DEET et d'ométhoate (deux insecticides utilisés pour tuer les moustiques), ainsi que du diéthylène glycol, un composé organique toxique.
«Il est important de savoir d’où viennent ces choses pour pouvoir les contrôler. Je pense que là où nous voyons cela, à long terme, c'est qu'avant d'acheter une maison, peut-être que vous ne le faites pas s'il y a de telles expositions à des produits chimiques dangereux », dit Snyder. "Je pense que cela vous permet de contrôler votre exposition à ces mauvaises choses."
Une montre intelligente plus intelligente
Il existe déjà des dispositifs permettant de mesurer les particules dans l'air, mais ils sont généralement statiques. Ils sont placés dans une pièce ou sur les toits de la ville, où ils peuvent mesurer le niveau de certains éléments mais ne peuvent pas détecter avec précision le genre de choses - dangereuses ou non - chaque individu est exposé à.
Le portable de Synder est différent. Même s’il le porte lui-même depuis deux ans, il est encore loin d’être raisonnable pour un usage quotidien pour la plupart d’entre nous. À l'heure actuelle, il est assez volumineux - environ la taille d'une grande boîte d'allumettes. Il doit également être attaché à la partie supérieure du bras afin de pouvoir prélever des échantillons d'air à environ un demi-litre par minute.
«Ce qui est spécial chez nous, c’est que nous l’avons sur la personne», dit Snyder. «Ce n’est pas mesurer ce à quoi une personne moyenne à New York ou une personne moyenne à San Francisco est exposée. C'est ta propre exposition."
Bien que le dispositif de Synder soit définitivement trop maladroit pour concurrencer Apple ou Samsung, son approche et son analyse exposome sont un domaine intéressant que la technologie portable n’a pas encore sondé. Bien que nous ayons des montres capables de détecter une arythmie cardiaque, nous n’avons pas encore vu une grande marque créer un appareil portable capable de détecter tous les composés différents et potentiellement dangereux dans l’environnement.
"Quelque part dans la chaîne, j'aimerais voir cela comme un appareil portable peu coûteux que tout le monde peut porter", dit-il. "Nous avons besoin d’une version peu coûteuse de cette version, que nous pouvons emporter partout où nous allons."
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