DE L'OR SOUS NOS PIEDS CHERCHEUR D'OR DANS LES RIVIÈRES DE FRANCE ORPAILLAGE GOLD PANNING
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La résistance aux antibiotiques est un problème dévastateur qui peut rendre la lutte plus difficile, mais quelque part dans la nature, il y a un animal sauvage dont la salive pourrait avoir les réponses que nous cherchons, selon les auteurs d'un article publié jeudi dans Actes de l'Académie nationale des sciences, qui se sont lancés dans une chasse à l'ours à la recherche d'un trésor microbien utile.
La mission attrape-et-relâcher avait pour but d’aider à identifier les thérapies potentielles qui pourraient se cacher dans le microbiome de l’ours, a déclaré le co-auteur de l’étude et professeur de génétique microbienne à l’Université Rutgers, Konstantin Severinov, Ph.D. Inverse. Mais il était essentiel pour cette enquête que les chercheurs utilisent un animal sauvage avec une bactérie intestinale non altérée par le monde moderne:
«Certaines données montrent que les animaux du zoo ont un microbiote beaucoup plus commun que les mêmes animaux si vous les emmenez à l’état sauvage», dit Severinov, mais à part cela, les animaux sauvages ont aussi tendance à être des individus plutôt chaleureux. «Les animaux sauvages mangent n'importe quoi et boivent dieu sait quoi. Donc, une hypothèse est que les microbes qui les habitent les protègent en quelque sorte."
L'identification de ces microbes et des composés potentiellement protecteurs qu'ils produisent pourrait être une méthode pour développer des traitements antibiotiques - bien que Severinov ajoute que cela n'a pas encore été complètement testé. Mais historiquement, cela ressemble à la façon dont nous avons trouvé nos outils de lutte contre les infections les plus importants dans le passé. Dans les années 1950, Selman Waksman a identifié une multitude d'antibiotiques dans les microbes du sol. comprenant la streptomycine, le premier anti-biotique utilisé dans le traitement de la tuberculose. Il a remporté un prix Nobel pour ce travail, ce qui a été fait de manière intéressante à l’Institut de biotechnologie Waksman, également affilié à cette étude récente.
Des milliers de minuscules tubes à essai
Utiliser la salive d'ours pour tenter de résoudre des problèmes humains est intéressant en soi, mais Severinov souligne que son article décrit également une technique permettant aux chercheurs de sonder n'importe quel type de microbiome, des humains aux dragons komoto (ils envisageaient d'utiliser ces lézards à la place de l'ours.) avec une rapidité et une précision inédites.
Au lieu de cultiver différents types de microbes dans une boîte de Pétri, ces chercheurs utilisent des milliers de minuscules gouttelettes d’huile pour étudier chaque aspect du microbiome de l’ours. Dans chaque gouttelette, ils ont pu combiner un microbe de la salive de l’ours, avec différents types de bactéries infectieuses, puis comparer à quel point chacun a réagi à la bactérie infectieuse.
«En gros, c’est comme avoir des milliers de petits tubes à essai dans lesquels chaque bactérie se développe sans que l’autre ne soit influencée, puis vous pouvez les trier et séparer celles que vous voulez de celles que vous n’aurez pas», explique-t-il.
L'analyse de ces milliers de gouttelettes a été couronnée de succès: une gouttelette dans laquelle toutes les bactéries infectieuses avaient été tuées. Severinov explique que cette gouttelette contenait une souche de Bacillus Pumilus, avec un ensemble de gènes qui l’a aidée à produire l’amicoumacine, un antibiotique courant connu pour traiter les infections à staphylocoques.
Matière noire microbienne
Bien que l’amicoumacine ne soit en aucun cas une nouvelle découverte, cette équipe a identifié quelque chose d’unique à propos de cette souche de B. Pumilus. Il avait un autre groupe de gènes qui le rendait également résistant à l'antibiotique qu'il produisait.
Cela n’a pas surpris Severin en particulier. «Si vous considérez un microbe qui produit des substances nocives, vous devez supposer que le microbe lui-même est résistant à ces substances nocives», explique-t-il. Ce sont des gènes codés pour une enzyme qui a provoqué une infime modification chimique de l’amicoumacine, la rendant incapable de tuer son hôte. Dans l'article, les auteurs le décrivent comme un «mécanisme unique d'auto-résistance à Bacillus».
Ce processus est loin d'être adapté à la médecine humaine, dit Séverin. Mais c'est une illustration que si nous continuons à chercher dans des endroits étranges, nous ne savons jamais ce que nous pourrions trouver et comment cela pourrait être utile plus tard.
"Il ya cette idée générale que nous ne connaissons peut-être pas 99% des microbes qui existent," dit Severin. «C’est comme de la matière noire parce que nous ne pouvons pas les cultiver ou parce que vous ne pouvez pas les atteindre», conclut-il.
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