Une famille de virus de la mer tueurs de bactéries découverte par des scientifiques

Quand vous pensez à un virus, vous pensez probablement aux agents microscopiques qui donnent à la vie terrestre le sentiment d'être un enfer infesté de mort. Il existe 219 espèces de virus connues pour infecter l'homme - le rhinovirus, le poliovirus, les souches de virus grippaux, etc., qui envahissent les cellules vivantes, se multiplient rapidement et vous rendent malade.

Dans l'océan, il y a environ 10 millions de virus par millilitre d'eau. Mercredi, des scientifiques ont annoncé avoir découvert une nouvelle famille de virus inédite à ajouter à ce mélange: des virus abondants et sans bactéries qui tuent les bactéries, possiblement liés à des virus bactériens envahissant l'intestin. Cette découverte a été publiée dans La nature et fabriqué par des scientifiques du MIT et du Collège de médecine Albert Einstein.

Ce groupe de virus - nommé Autolykiviridae après Autolycus, un personnage particulièrement insaisissable de la mythologie grecque - n’a jamais été analysé auparavant car les tests précédents n’ont pas permis de les détecter. Alors que la plupart des virus sur terre et Dans l’océan, il ya des virus à ADN double brin équipés d’une «queue» qui infecte les bactéries. Ce nouveau groupe appartient à la famille des non-queues, qui était historiquement beaucoup plus difficile à analyser.

le Autolykivirdae sont supposés jouer un rôle écologique important dans l’océan en tant que bactéries tueuses majeures. Dans le cadre de cette étude, les chercheurs ont prélevé des échantillons d’eau au large des côtes du Massachusetts, puis les virus trouvés dans ces échantillons ont été incubés aux côtés d’une famille de bactéries marines appelée Vibrionaceae. Les chercheurs ont ensuite analysé les génomes des virus qui ont infecté la bactérie avec succès. Sur les 200 virus collectés, 18 n’étaient pas reconnus auparavant et n’avaient pas été suivis - le Autolykivirdae.

Ils ont ensuite libéré le nouveau groupe de virus sur 300 souches de bactéries marines et ont comparé les dommages infligés par le nouveau groupe par rapport aux virus à la queue. Bien que le nouveau groupe ne représente que 10% des virus observés, ils 40 pour cent de tuer bactérien. Étant donné que ces prédateurs océaniques microscopiques étaient capables d'infecter des bactéries marines capturées en dehors des eaux du Massachusetts, les chercheurs ont été amenés à croire que ce groupe pourrait potentiellement prospérer dans tout l'océan.

Une analyse plus poussée a également révélé que les génomes du nouveau groupe étaient en réalité plus petits que ceux d’autres virus: leur génome se composait de 10 000 bases, contre 40 000 à 50 000.

"Lorsque nous avons découvert cela, nous avons été surpris", a annoncé le co-auteur Martin Polz, Ph.D., dans un communiqué publié mercredi.

Polz et son équipe soupçonnent également que ce nouveau groupe de virus n'est pas spécifique à l'océan et pourrait être commun au sein du biome humain. Les virus, liés à une ancienne lignée qui a déjà été trouvée chez des animaux et des organismes eucaryotes comme les algues, pourraient avoir un effet sur le microbiome intestinal humain, ont déclaré les chercheurs.

Bien que nous ne pensions pas généralement que les virus soient bons, certains virus peuvent protéger les humains contre les bactéries, provoquant des événements tels que la création de mucus, qui peut chasser les germes. Nous n’avons pas une très bonne idée de ce qu’ils font exactement, mais le tractus gastro-intestinal des mammifères est rempli de virus - ce qui suggère qu’ils jouent probablement un rôle important dans le maintien de notre santé.

À son tour, ce groupe de virus récemment découvert tue les bactéries des océans, considérées comme des composants clés de la chaîne alimentaire, et on pense que cette interaction biologique permet de maintenir l'équilibre écologique. Tous les virus ne sont pas créés égaux, mais nous ne sommes qu’au sommet de l’iceberg pour comprendre l’ampleur de ce qu’ils peuvent faire.

Si vous souhaitez en savoir plus sur ce nouveau groupe de virus, consultez cet explicatif de Libusha Kelly, co-auteur de l'étude, Ph.D., professeur adjoint au Albert Einstein College of Medicine.